Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms