Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms