Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ERCC6Q03468 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6Q03468 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms