Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK16Q00536 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms