Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIM1P81133 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIM1P81133 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIM1P81133 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIM1P81133 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIM1P81133 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIM1P81133 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIM1P81133 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms