Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL8P80075 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL8P80075 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL8P80075 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL8P80075 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL8P80075 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL8P80075 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL8P80075 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCL8P80075 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms