Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2A1P68400 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms