Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF6P62330 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF6P62330 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF6P62330 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF6P62330 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF6P62330 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARF6P62330 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF6P62330 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF6P62330 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF6P62330 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF6P62330 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF6P62330 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF6P62330 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms