Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RPS29P62273 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms