Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms