Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms