Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLF3P57682 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF3P57682 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF3P57682 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF3P57682 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF3P57682 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms