Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms