Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms