Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRAP54198 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HIRAP54198 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HIRAP54198 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HIRAP54198 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HIRAP54198 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIRAP54198 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms