Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDGFP51858 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HDGFP51858 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HDGFP51858 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HDGFP51858 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDGFP51858 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDGFP51858 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDGFP51858 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDGFP51858 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDGFP51858 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDGFP51858 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDGFP51858 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDGFP51858 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDGFP51858 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDGFP51858 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDGFP51858 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDGFP51858 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDGFP51858 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDGFP51858 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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