Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK8P49336 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK8P49336 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK8P49336 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms