Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NESP48681 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NESP48681 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NESP48681 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NESP48681 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NESP48681 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NESP48681 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NESP48681 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NESP48681 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NESP48681 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NESP48681 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NESP48681 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
NESP48681 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
NESP48681 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NESP48681 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NESP48681 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NESP48681 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NESP48681 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NESP48681 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NESP48681 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NESP48681 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
NESP48681 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NESP48681 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
NESP48681 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NESP48681 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NESP48681 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NESP48681 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NESP48681 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NESP48681 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NESP48681 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NESP48681 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NESP48681 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NESP48681 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NESP48681 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NESP48681 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NESP48681 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NESP48681 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NESP48681 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NESP48681 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms