Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTDSS1P48651 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms