Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA2P47869 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms