Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACADSBP45954 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms