Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NUP62P37198 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NUP62P37198 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NUP62P37198 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NUP62P37198 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms