Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGFBR1P36897 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms