Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX11P35716 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX11P35716 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX11P35716 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms