Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms