Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD247P20963 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD247P20963 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD247P20963 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD247P20963 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CD247P20963 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD247P20963 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD247P20963 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD247P20963 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms