Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CXCL2P19875 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CXCL2P19875 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms