Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms