Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBTFP17480 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBTFP17480 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBTFP17480 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBTFP17480 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBTFP17480 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBTFP17480 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBTFP17480 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBTFP17480 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBTFP17480 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBTFP17480 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBTFP17480 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBTFP17480 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBTFP17480 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBTFP17480 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBTFP17480 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBTFP17480 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBTFP17480 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBTFP17480 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms