Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPGDP15428 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPGDP15428 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HPGDP15428 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms