Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LYL1P12980 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYL1P12980 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYL1P12980 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYL1P12980 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYL1P12980 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYL1P12980 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ 0
LYL1P12980 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYL1P12980 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LYL1P12980 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LYL1P12980 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LYL1P12980 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LYL1P12980 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms