Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HKR1P10072 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HKR1P10072 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HKR1P10072 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HKR1P10072 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HKR1P10072 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HKR1P10072 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HKR1P10072 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HKR1P10072 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HKR1P10072 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HKR1P10072 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HKR1P10072 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms