Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV1-8P0DP01 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV1-8P0DP01 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms