Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGPD1P0DJD0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms