Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CT47B1P0C2W7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CT47B1P0C2W7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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