Protein–RNA interactions for Protein: P09923

ALPI, Intestinal-type alkaline phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPIP09923 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALPIP09923 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALPIP09923 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPIP09923 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALPIP09923 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms