Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms