Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEFLP07196 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEFLP07196 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEFLP07196 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEFLP07196 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEFLP07196 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEFLP07196 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEFLP07196 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEFLP07196 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFLP07196 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms