Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK1P06493 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK1P06493 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK1P06493 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK1P06493 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK1P06493 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK1P06493 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK1P06493 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK1P06493 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK1P06493 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK1P06493 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK1P06493 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK1P06493 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK1P06493 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK1P06493 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK1P06493 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms