Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFNA4P05014 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms