Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOA1P02647 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms