Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE8BO95263 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms