Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NIPSNAP2O75323 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms