Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP3O75154 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB11FIP3O75154 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms