Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATG13O75143 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATG13O75143 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG13O75143 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG13O75143 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATG13O75143 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms