Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTNSO60931 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTNSO60931 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNSO60931 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNSO60931 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNSO60931 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNSO60931 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms