Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAK2O60296 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms