Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD28O15084 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms