Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KDM6BO15054 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM6BO15054 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
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