Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSPAN4O14817 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN4O14817 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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